中國是世界上人口最多的發展中國家，2009年底總人口數超過為13億，GDP約為4.76兆美元，已成為全球快速發展的強大經濟體，其廣大的勞動力及市場潛力深受全球重視，為了爭取廣大的醫藥市場，全球生技醫藥相關廠商紛紛進駐大陸搶佔先機。台灣市場小、產業規模不大，經營拓展不易，使廠商對整體環境與局勢變化相當敏感，由中國市場的崛起，希望能藉地利與同文同種之便，取得機會與優勢。因此，如何透過兩岸的合作，提升台灣生技廠商的國際競爭力，創造全球佈局的商機，是我國產業發展重要的一環。
一、中草藥產業
中草藥產業在全球回歸自然的風潮與植物藥物開發的帶動下蓬勃發展，也是中國大陸與台灣的生技醫藥產業上具有特色、利基與發展潛力的產業。
（一）中國大陸
2009年中國大陸的中成藥與藥材／飲片工業產值超過人民幣2,500億元；新公布的「基本藥物目錄」及「新醫保目錄」中，中成藥所占的比重達到1/3，並將訂有國家標準的飲片，也視為藥物；中國政府在政策上，大力支持中醫藥的發展；在市場規模、原物料供應與製造成本上，中國中草藥產業具有良好的優勢與發展利基。
大陸中藥產業鏈雖然完整，但原料安全與品質有待加強，研發投入不足，製造廠商存在「散、小、多、亂」的問題，面對未來日益激烈的競爭，產業結構有待調整。近年來大陸政府已加強對中藥產品的審查與監管，並鼓勵廠商進行併購與聯盟，淘汰體質不佳的廠商，期能將產業導向更為現代化的方向。
（二）我國
我國中草藥藥品受限於法律規範，有新舊之分。經中醫藥委員會訂定之「基準方」，不需要經過臨床試驗，但產品缺乏創新與差異化；中藥/植物新藥為1998年後政府政策大力支持的產業，不過新藥產出需要相當長久的時間，我國中草藥新藥雖然蓬勃發展，但產業規模尚未成型。
我國中草藥產品原料極度倚賴進口，故產業鏈上游有缺口存在。台灣中草藥廠商的優勢在於製造、質控、經營管理與客戶服務，並具有商業靈敏度。
（三）兩岸競合
兩岸中草藥產業最好的合作策略，是優勢整合，產業鏈垂直互補。中國大陸在原料與市場兩端具有優勢，中游部分雖然成本低廉但品質差異大；我國的強項在於GMP製造、質控、管理與服務等軟體系統之建置。至於新產品的開發，是兩岸產業提升競爭力持續需要的項目，可以交流合作的方式進行。
不過，「雞蛋不能放在同一個籃子裡」，面對國際市場，兩岸仍然處於競爭的位置。我國廠商應該穩固根基，分散風險，在管理和智財保護上努力，開發及維持核心技術的特色優勢，放眼世界，尋找永續經營的策略。
二、委外研發服務（CRO）產業
藥廠為了縮短研發時程、提升成功率而將研發的工作委外，提供研發服務的公司，稱之為CRO（Contract Research Organizations）。
全球約有1,100餘家大大小小的CRO，有些提供新藥探索服務，有的提供臨床前或臨床試驗的服務，有些則提供全方位的服務，是一個動態而競爭激烈的產業。全球CRO產業於2009年的總營收約216億美元，年成長率約10%。
（一）中國大陸
近年國際大藥廠為了節省成本，利用美而廉的專業人力，委外研發市場大量轉向新興地區，基於市場潛力及成本優勢，中國大陸成為大藥廠佈局的重點。
中國大陸有300多家CRO，包括許多國際級頂尖CRO之進駐，2009年新藥探索方面的市場約3.2億美元，而臨床試驗則有約2.6億元的市場。
在化學服務的非臨床試驗CRO方面，中國大陸專業人力薪資與歐美相較相對低廉，海歸派創建的公司因具西方教育背景及產業經驗，已成為產業發展的主力，如藥明康德及尚華醫藥集團等。
在臨床前試驗方面，中國大陸藥理及生物之人力資源及靈長類動物供應的優勢，已受到國際大型藥廠的注意，如全球第一大動物實驗CRO公司Charles River Laboratories於2007年進軍大陸，Pharmaron收購中國維通博際，尤有勝之的是，Charles River於2010年4月斥資16億美元擬收購藥明康德新藥開發公司，後雖因股東方對而作罷，但仍可視為一指標事件。
在臨床試驗方面，豐富的臨床病例和日漸成熟的臨床科研人員，可有效降低運作成本，加上某些領域雄厚的科研基礎，和豐富獨特的疾病資源，在在增加了於中國進行研發的吸引力，國際型CRO紛紛進入中國，全球第三大CRO公司～PPD, Inc.亦於2009年11月收購中國第一大CRO～北京依格斯醫療科技公司。
由於成本、人才等優勢，中國逐漸融入了全球藥品研發體系。但因整體規模膨脹，造成市場及人才的競爭，高利潤的好景於近兩年逐漸消褪。中國大陸CRO間朝向橫向整合，擴充服務項目，以為客戶提供便捷的一站式服務來因應，期能構建競爭力、提升盈利能力。
（二）我國
由研發服務業的產業結構來看，我國在新藥探索期的化學合成、篩選及先導化合物最適化服務等方面較為欠缺，在國際市場上，此類服務幾乎已被中、印兩國囊括。
在臨床前試驗CRO方面，有汎球藥理研究所、財團法人生物技術開發中心毒理與臨床前測試中心、進階生物科技、昌達生化科技、及麥德凱生科公司等。生技中心毒理與臨床前測試中心及進階生物科技兩家CRO機構於2008年6月獲得經濟合作暨發展組織（Organization for Economic Co-operation and Development, OECD）之認可。昌達生化科技及麥德凱生科公司，則於2009年9月陸續獲得行政院衛生署核發的藥物非臨床試驗優良操作規範（GLP）認證。
在臨床試驗方面，明生、維州、晉加、國際精鼎、佳生、全面顧問、世宬、昌達、保瑞爾、台塑生醫、華鼎等公司先後成立。在新興市場崛起的情形下，多家廠商已由本土市場走向海外，主導亞太臨床研究，無論在專業領域、國際佈局上均有很好的表現。由於「佈局亞太，放眼全球」的策略奏效，國際精鼎於2007年間被全球第四大CRO-Parexel收購，成為國際公司之亞洲研發及營運中心，讓我們的產業又跨進了一步。
不自外於國際潮流，國內廠商亦進行併購及聯盟。如昌達生技公司主要業務在於執行藥物動力學及藥理實驗，正藉由併購及聯盟方式擴充其服務鏈。一方面取得生物技術開發中心毒理實驗室民營化的最適申請人資格，朝向毒理試驗擴充，另一方面收購華鼎生技顧問公司六成股權，切入臨床試驗的領域，與華鼎的母公司健亞合作，拓展大中華區臨床試驗市場。
對我國而言，最需突破的瓶頸在於市場。我國內需市場小，如何進入全球之研發供應鏈體系，是CRO產業的關鍵議題。
（三）兩岸競合
我國CRO最大的瓶頸在於市場之局限，目前大陸市場崛起，成為歐美國家外包的首選，若能於兩岸解凍之際，結合兩岸優勢，拓展國際市場，是我國產業應及時掌握的發展機會。
在非臨床實驗方面，兩岸CRO可各以不同的服務強項聯合接單，來開發歐美市場。在臨床試驗方面，則藉我國SMO之經驗傳承，及藉主導亞太臨床試驗的經驗，與中國大陸CRO合作，擴大服務市場。我國CRO亦可與國際CRO合作，成為進入中國大陸之中介樞紐。
除此之外，我國CRO亦需於資金、技術及管理等方面深植實力，以利海外接單，或與其他國家的藥物研發機構或CRO合作，建立本身之競爭力於不墜。
國內CRO健全發展的意義，除了開拓海外市場外，最重要的在於協助國內藥物開發公司，進行藥物開發的技術及法規支援，於國際經驗的累積中，有望協助國內新藥開發的效率及成功率，這是政府建立CRO基磐建設及鼓勵CRO的終極目的。相對而言，CRO若能於國內生根，需要台灣新藥開發的持續進行與成功，我國藥廠於近年重視新藥的開發，將成為CRO產業永續經營的基石。